学校现有青藏高原民族研究基地、青藏高原语言文学重点研究基地、青藏高原环境资源法学研究基地、青藏高原非物质文化遗产保护与传承研究基地等4个国家民委人文社会科学重点研究基地;青藏高原资源化学与生态环境保护国家民委重点实验室、青藏高原藏药资源保护与开发国家民委重点实验室、人工智能应用技术国家民委重点实验室、青海省青藏高原植物化学重点实验室、青海省特色经济植物高值化利用重点实验室、青海省纳米材料与技术重点实验室、青海传统药物研发联合实验室等7个重点实验室;1个省级协同创新中心:藏药传承与可持续发展协同创新中心;1个省级工程技术研究中心:现代藏药创制工程技术研究中心。